通風柜的排風系統(tǒng)(system)可分為集中式和分散式兩種。集中式是把一層樓面或幾層樓面的的通風柜組成一個系統(tǒng)，或者整個實驗樓分成一二個系統(tǒng)。它的特點是通風機（Draught Fan）少，設備投資（意義：是未來收益的累積）省，而且對通風柜的數(shù)量稍有增減，以及位置的變更，都具有一定的適應性。然而由于系統(tǒng)較大，風量不易平衡，盡管每個通風柜上都裝有調節(jié)閥，但使用不方便，并且也不容易達到預定的效果。如果系統(tǒng)風管損壞需要檢修時，那么整個系統(tǒng)的通風柜就沒有辦法使用。所以，原來采用集中式系統(tǒng)的實驗室，先后都改為用分散式系統(tǒng)。 
    分散式是把一個通風柜或同房間的幾個通風柜組成一個排風系統(tǒng)。P4實驗室結構和設施、安全操作規(guī)程、安全設備適用于對人體具有高度的危險性，通過氣溶膠途徑傳播或傳播途徑不明，尚無有效的疫苗或治療方法的致病微生物及其毒素。他的特點是：可根據(jù)通風柜的工作需要來啟閉通風機，相互不受干擾，容易達到預定的效果，而且比集中式節(jié)省(spare)能源，因為集中式系統(tǒng)，只要一個通風柜在使用，就得開動大通風機。分散式由于系統(tǒng)小，排風量也小，阻力也小，所以通風機的風量、風壓都不大，躁聲與振動相應也較小。分散式還有一個特點，是對排出不同性質的有害氣體易于處理。缺點是通風機的數(shù)量多、系統(tǒng)多，如果通風機集中于通風機房內，那么投資就會增大，如果通風機分散布置，而且就地安裝，雖然通風機的投資增加，但風管的投資可節(jié)省，最后總投資不一定增大。建議使用分散式。     在劃分系統(tǒng)時，同一個房間內如有兩個以上的通風柜，應劃為一個系統(tǒng)，避免一個通風柜在使用，其他的通風柜產生倒流，使室內受到感染。同樣，一個房間內除了一個排風系統(tǒng)外，不宜再裝置其他排風設備。 
    工廠實驗室排風系統(tǒng)的通風機（Draught Fan），一般都裝在屋頂上，或頂層的通風機房內，這樣可不占用使用面積，而且使室內的排風管道處于負壓狀態(tài)，以免有害物質由于管道的腐蝕或損壞，以及由于管道不嚴密而滲入室內，此外，通風機安裝在屋頂上或頂層的通風機房內，檢修方便，易于消聲或減振。實驗室設備實驗脊椎動物生物安全防護實驗室，其適用微生物范圍與同級的一般生物安全防護實驗室相同。 
    排風系統(tǒng)(system)有害物質排放高度應按現(xiàn)行的《工業(yè)公司設計衛(wèi)生標準》和《工業(yè)三廢排放標準》執(zhí)行。實驗室設備每類生物安全防護實驗室根據(jù)所處理的微生物及其毒素的危害程度各分為四級。各級實驗室的生物安全防護要求依次為：一級最低，四級最高。在一般情況下，如果附近五十米以內沒有比較高建筑物時，排放高度應超過建筑物最高處兩米以上。