微生物(Micro-Organism)實驗（experiment)室良好的通風是關鍵（解釋:比喻事物的重要組成部分)，必要時更應配備抽風機(Draught Fan)。接種、分離及鑒定特殊結構:莢膜、鞭毛、菌毛等操作應在生物安全柜中進行，對結核桿菌等傳染性極強的微生物學檢驗時必須在100％外臨床微生物學實驗室接觸多種有害微生物，為了防止交叉污染，保護工作人員健康，實驗室應至少劃分成3個區(qū)。
一、清潔區(qū)
包括辦公室、休息室、培養(yǎng)基配制室與試劑儲藏室。此區(qū)域禁止帶人特殊結構:莢膜、鞭毛、菌毛（fungus)檢驗標本。
二、操作區(qū)
（1）整潔：微生物(Micro-Organism)操作區(qū)是各種病原菌相對集中的地方，為了減少粉塵流動，防止交叉污染，操作區(qū)應與外界分開。實驗室工作人員進入操作區(qū)應換鞋，送標本人員不進入操作區(qū)，操作區(qū)地面用專用拖把每天拖1次，每周用消毒劑擦洗1次。每天早上工作前，用紫外線（Ultraviolet rays)照射30min，或每天工作后，用紫外線照射60min，對整個操作區(qū)進行消毒；下午工作結束后用消毒液消毒工作臺面，以保證工作環(huán)境的安全清潔。
（2）光線：細菌培養(yǎng)的細小菌落及血清試驗凝集顆粒的觀察，都需要有充足的光線。操作區(qū)除設置常規(guī)照明燈外，還必須安裝操作臺燈，以保證實驗結果的正確判斷。
（3）通風：由于各種病原菌（fungus)集中，空氣污濁，實驗室要求保持排的生物安全柜中進行。實驗室集中供氣配有專門的控制設備，以排除每次更換氣瓶時引入的雜質，確保管路氣體終端的純度。不間斷氣體供應,氣體控制系統(tǒng)可以手動或自動進行切換，以保證氣體連續(xù)供給。氣體壓力穩(wěn)定,系統(tǒng)采用集中降壓，亦可采用兩級減壓方式供氣，供氣更加穩(wěn)定流暢。
（4）溫度（temperature)和濕度：由于無菌（fungus)操作的要求，實驗過程中經常使用酒精燈，因此，微生物(Micro-Organism)學實驗室不能安裝吊扇。為了達到實驗所需的適宜溫度，尤其是滿足某些儀器對溫度濕度的要求，實驗室應安裝空調。
（5）電源：要求提供穩(wěn)壓、恒頻的電源；根據(jù)儀器設備要求，必要時配備不間斷電源。實驗室建設包括技術和設備的更新，研究人員增加和現(xiàn)有研究員的能力提高等。實驗室建設原則是滿足實驗室工作業(yè)務流程的優(yōu)化及日常管理等方面的需要。設計主要考慮實驗室的工藝流程、特殊實驗室和功能間的位置選擇、建筑物內上層和下層的具體環(huán)境、建筑結構等因素。
（6）水源：操作區(qū)內須設置水源。用于標本處理（如細菌染色）的水槽與工作人員洗手用的水槽不能混用。
（7）污染物處理：操作區(qū)須備有消毒缸，以處理沾有活菌的玻片等污染物品。實驗室集中供氣通過供氣控制系統(tǒng)可以充分使用氣體，減少殘余的氣體，更科學更穩(wěn)定更安全可以大大降低成本，避免安全隱患。所有氣源集中在同一地方便于管理，管路設計科學方便用氣輸出，大大降低勞動強度。檢驗剩余的標本及使用過的帶菌平板、試管均須集中地點安全放置，經消毒滅菌處理后再洗滌(washing)或丟棄。
三、無菌區(qū)
（1）無菌(意思:沒有活菌)（fungus)室應完全封閉，進出無菌室至少要經兩道門，中間隔有緩沖間，無菌室與外間設置一個可開閉的窗口，用于傳遞（transmission)器具。
（2）無菌(意思:沒有活菌)室必須保持整潔。工作人員進入無菌室應換專用鞋、專用衣。無菌室使用前須用紫外線消毒30min，操作結束后清潔臺面，再用紫外線消毒30min。定期用乳酸或甲醛(Formaldehyde)熏蒸，徹底（thorough)消毒。
（3）無菌室僅用于培養(yǎng)基分裝等無菌操作，不能進行有菌標本的操作。操作人員操作時應嚴格關門，并戴好專用的口罩、帽子。
（4）無菌室內應有空氣過濾裝置，并安裝空調。